遗传及细胞生物学教研室Brief Introduction

陈振夏
时间:2016-09-20

陈振夏  博士  教授  博士生导师

教育经历

2002-2006 华中农业大学 生命科学技术学院 国家生命科学与技术人才培养基地 理学学士学位

2003-2006 武汉大学 新闻传播学院学院 新闻学 文学学士学位

2006-2011 北京大学 生命科学技术学院 生物信息中心 理学博士学位

 

科研与学术工作经历

20016-至今 华中农业大学生命科学技术学院 教授

2011-2016 美国国立卫生研究院 消化、糖尿病、肾脏病研究所 博士后

 

研究方向

癌症是人类的健康杀手,对癌症发生的研究是生物医学的重点内容。癌症发生是一个演化过程在此过程中,基因组在各种演化力量的作用下发生了单核苷酸变异、小片段的插入/缺失突变、以及拷贝数变异和倒位等大的结构性变异。癌细胞的演化产生了大量的多样性,使得患有同一种癌症的不同病人有遗传上不同的肿瘤。另外,即使在同一病人体内,癌细胞的演化也会随着细胞分裂和随机突变造成肿瘤内的异质性。近年来,高通量测序技术的发展推进了人类癌症基因组演化的研究。本实验室运用高通量测序技术,结合遗传学、分子生物学、发育生物学、演化生物学和生物信息学等手段,研究基因组变异对癌症发生的影响。

本实验室真诚欢迎热爱科学、擅长学习和乐于合作的本科生、研究生、博士生、博士后和其他科研人员的加入。

 

代表性研究成果

论文

1.Chen ZX, Golovnina K, Sultana H, Kumar S, Oliver B. 2014. Transcriptional effects of gene dose reduction. Biology of sex differences 5(1): 5.

2.Chen ZX, Oliver B. 2015. X Chromosome and Autosome Dosage Responses in Drosophila melanogaster Heads. G3 5(6): 1057-1063.

3.Chen ZX*, Oliver B, Zhang YE, Gao G, Long M. 2017. Expressed Structurally-stable Inverted Duplicates in Mammalian Genomes as Functional Noncoding Elements. Genome biology and evolution.

4.Chen ZX, Sturgill D, Qu J, Jiang H, Park S, Boley N, Suzuki AM, Fletcher AR, Plachetzki DC, FitzGerald PC et al. 2014. Comparative validation of the D. melanogaster modENCODE transcriptome annotation. Genome Res 24(7): 1209-1223.

5.Chen ZX, Zhang YE, Vibranovski M, Luo J, Gao G, Long M. 2011. Deficiency of X-linked inverted duplicates with male-biased expression and the underlying evolutionary mechanisms in the Drosophila genome. Molecular biology and evolution 28(10): 2823-2832.

6.Clough E, Jimenez E, Kim YA, Whitworth C, Neville MC, Hempel LU, Pavlou HJ, Chen ZX, Sturgill D, Dale RK et al. 2014. Sex- and tissue-specific functions of Drosophila doublesex transcription factor target genes. Developmental cell 31(6): 761-773.

7.Lin Y, Chen ZX, Oliver B, Harbison ST. 2016. Microenvironmental Gene Expression Plasticity Among Individual Drosophila melanogaster. G3 6(12): 4197-4210.

8.Lin Y, Golovnina K, Chen ZX, Lee HN, Negron YL, Sultana H, Oliver B, Harbison ST. 2016. Comparison of normalization and differential expression analyses using RNA-Seq data from 726 individual Drosophila melanogaster. BMC genomics 17: 28.

 

其他成果

发表数据集

1. Golovnina K, Chen ZX, Lin Y, Sultana H, Oliver B, Harbison S, 2015. mRNA sequence data of individual Drosophila melanogaster male and female flies from 16 Drosophila Genetic Reference Panel lines reared in replicated environments. Gene Expression Omnibus GSE60314.

2. Chen ZX, Oliver B. 2015.  mRNA-Seq of female, male, and sex-transformed Drosophila melanogaster heads from flies heterozygous for deletions on chromosome X and 3L. Gene Expression Omnibus GSE60571.

3. Chen ZX, Oliver B. 2015. CAGE-Seq of gonads and carcasses from D. melanogaster and D. pseudoobscura. Gene Expression Omnibus GSE66284.

4. Sturgill D, Chen ZX, Kopp A, Richards S, Oliver B. 2013. mRNA-Seq of whole adult females and males, and mixed sex embryos, from multiple Drosophila species. Gene Expression Omnibus GSE43321.

5. Oliver B, Chen ZX, Sturgill. 2013.  New Drosophila pseudoobscura RNA-Seq coverage data. FlyBase. http://flybase.org/cgi-bin/gbrowse/dpse/

 

发表社科文章

龙漫远 陈振夏. 达尔文和他改变的世界. 科学文化评论. 6(4): 13-26 (2009).

陈振夏. 大学生课外活动参与状况调查与研究. 华中农业大学学报(社科版), 5,6: 118-121 (2005).

 

发表科普文章

陈振夏. 果蝇的祖先天生双性恋?牛顿科学世界, (2010)

陈振夏. Y染色体少了,男人要没了? 南都周刊, (2009)

陈振夏. 兴趣不是奢侈品. ——从喜欢花鸟虫鱼的日本皇子说起. 科学时报, (2008).

 

其他发表文章

Chen ZX. Genomics: A promising investment opportunity.  BiotechBlog (2014).

陈振夏. 《在燕园留下的第一次》. 霍晓丹 编著. 《绚彩燕园青春北大——60位北大优秀毕业生的校园记忆》, 北京大学出版社 (2011).

 

获得奖励

北京大学优秀毕业生,北京大学,2011

北京大学优秀博士学位论文,北京大学,2011

女科学家旅行奖,第十届国际基因组学大会,2015

杰出科学家奖,美国国立卫生研究院学生学者联谊会,2016

 

讲授课程

生物信息学,生命科学导论(慕课)

 

研究生招生专业

基因组学 发育生物学

 

联系方式

电话:18086113785

电子邮箱:zhen-xia.chen@mail.hzau.edu.cn

办公地点:基因楼418-420

 

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中国·湖北·武汉 南湖狮子山街一号430070 Tel:+86-27-87282101 Fax:+86-27-87282469
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