科研进展Brief Introduction

罗杰课题组水稻代谢组研究再获新进展
时间:2016-10-08

2016104日在线出版的Nature Communications发表了题为“Comparative and parallel genome-wide association studies for metabolic and agronomic traits in cereals”的研究论文。论文的通讯作者为我校作物遗传改良国家重点实验室水稻团队的罗杰教授,陈伟博士及博士研究生王文升、彭梦为该文的共同第一作者。

该论文在前期水稻叶片Chen et al., Nat Genet, 2014, 46:14-721及玉米籽粒(Wen et al., Nat Commun, 2014, 5:3438代谢组研究基础上,对水稻种子代谢及农艺性状的遗传基础开展研究。论文首先揭示了水稻代谢物的遗传调控存在明显的组织特异性,且这种特异性部分受到组织特异性表达的等位基因控制。在此基础上,利用水稻和玉米在遗传定位效力及定位精度方面互补的特点,通过比较全基因组关联分析,同时提高了基因定位的效力和定位精度,确定了近20个新的控制水稻种子代谢物含量的候选基因,并对其中部分基因进行了功能验证。另外,通过对水稻种子农艺(颜色、粒重、粒厚、粒长和粒宽)及代谢性状共调控的平行全基因组关联分析,克隆并鉴定了部分同时影响代谢及农艺性状的基因。例如,控制葫芦巴碱合成的关键基因氧甲基转移酶(Os02g57760)既控制葫芦巴碱的含量,同时也影响水稻粒宽。上述研究促进了作物代谢物遗传及生化调控的解析,提供了代谢与农艺性状关联的直接证据,同时提供了利用交互功能基因组及代谢组进行作物复杂性状解析的新手段。

 

 

论文链接: http://www.nature.com/articles/ncomms12767

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